很好的问题。
在《火影忍者》中，自来也在去雨隐村搜集晓组织的情报时，被佩恩六道也就是长门杀害，尸体沉入雨隐村的大海里。因为找不到足够的DNA，所以在第四次忍界大战的时候，自来也也没有被秽土转生出来。
而在《博人传》的最新剧情中，出现了一位自称果心居士的反派人物，果心居士戴着面具所以无法知道他的真实面貌和身份，但是从体貌特征和忍术招式上看他很像是自来也，我认为果心居士极有可能是自来也。
1.通灵术
自来也和波风水门还没有鸣人的通灵兽都是妙木山的蛤蟆，而果心居士虽然也能通灵蛤蟆，但是单凭这点不足以证明果心居士就是自来也。不过如果要想通灵妙木山的蛤蟆，就必须签订契约，所以博人完全可以拜托鸣人或者木叶丸查查有哪些人签订了契约，根据年龄推算，其实不难找到，但是既然没有提到这点，极有可能此人就是自来也，所以在契约上才找不到线索。
2.螺旋丸
木叶丸在和果心居士交手时，果心居士施展了螺旋丸，而且木叶丸可以证实这个螺旋丸不是由科学忍具施展的，是果心居士自己使出来的。目前在忍界可以使用螺旋丸只有自来也这一师承，所以他是自来也的可能性极大。
3.脸上的彩妆
自来也的形象特点之一就是脸上眼睛下面两道红色的彩妆，而果心居士虽然戴着面具，但是在眼睛部位也有这样的彩妆。
可能有的小伙伴会说两人的彩妆位置有所不同，自来也的是在眼睛正下方，而果心居士是在靠近眼角的位置。但是，恰恰因为这样才说明果心居士就是自来也，因为自来也的彩妆位置是一直在变化的，年轻时候的自来也的彩妆就是在眼角那个位置。
至于说自来也是如何复活的，这就要问作者了，其实极有可能是大蛇丸复活了自来也，因为能够有自来也细胞的人除了纲手就只有大蛇丸。极有可能是大蛇丸使用了什么禁术比如说秽土转生召唤了自来也，以上就是我的回答。
我认为果心居士很有可能就是自来也，理由如下:
①通灵兽是蛤蟆
②会螺旋丸（当他使出螺旋丸时，周围人都很吃惊，可见当时木叶除了鸣人和木叶丸应该没人会螺旋丸了）
③有与自来也一样的眼影
在看了博人转漫画后，我猜测:
壳组织是慈弦领导的组织，且科学忍术水平已经相当高级。慈弦是一个与大筒木桃氏，金氏和辉夜并肩的存在（详见博人转第35话），且拥有十尾。若加上科学忍具的帮助，足以将佐助与鸣人按在地上摩擦。所以，自来也应该是被打入江底后，被壳组织的人救起（壳组织的技术足以将重伤的自来也恢复），且用科学忍具安装义肢。自来也发现慈弦的巨大威力后，不敢轻易回村，于是待在了壳组织收集情报（自来也本身便是一个优秀的情报收集专家），寻找打败慈弦的方法（漫画中可以看出果心居士对壳组织并不忠诚）。在找不到方法前，自来也应该不会暴露自己身份。
本人认为博人转漫画还是很不错的，剧情也可以（不过鸣人画的是真的丑）。而动漫那冗长的剧情可能是因为动漫才刚起步，没有进入主线。火影忍者动漫在一百多集到二百多集疾风传开始前不也是没完没了的任务吗？当时骂的人也不少。不过我相信博人转动漫在进入主线后应该会越来越精彩，看的人也会越来越多吧！
先不说别的，我看博人传漫画，岸本放了一张封面，画的是果心居士小时候。果心居士小时候非常像自来也，而且果心居士自己说与木叶有连系，他在进入木叶后也没触发警报，最重要的是，封面的题目是木叶英雄的遗产，再加上果心居士有点亦正亦邪，有点像当年的鼬，所以我感觉果心居士有可能是自来也的后代。（也有人说是猿飞新之助）
说不定果心是自来也的弟弟，果心居士毁了大半个忍界，然后最后自来也突然出现，为了忍界大义杀死了他的弟弟，鸣人和佐助死前把博人和村子托付给自来也，之后自来也带着博人修行，自来也成为第八代火影，木叶丸第九代，佐良娜第十代，佐良娜和博人结婚，全剧终
我的名字叫自来也，其实在佩恩轮回天生时我就复活了，一直在海底养伤。刚养好出来时，听到一声：“这是我为你准备的六千亿爆炸符！”于是我又会海底养伤。又养好出来时，听到一句：“十尾尾兽玉已经转移到海面上了！”于是我化身为果心居士报复忍界。
六道仙人复活他弟弟，用了蛤蟆的宝贝，一张符。自来也濒死前用那符，很正常。
复制人也可能。毕竟自来也没有找到尸体，入木业墓地，三忍中其它两个都在，不可能单单少自来也。
自来也本身就是流浪调查，各种势力，符合角色的存在逻辑。
