管道和冲水孔是我们在清洗的时候较容易忽略的，并且建议大家每个星期至少要清洗一次，过滤器也要每个月清洗一次。在清洗的时候可以使用手把较长的尼龙毛刷再加上一些肥皂水和中性的清洁剂进行清洗。清洗马桶圈，冬天的时候，因为冷，所以很多人都会在马桶圈上装上马桶垫，其实这个是不提倡的，因为马桶垫很容易滋生细菌，如果使用一定要定期进行清洗，马桶盖也是，一定要定期清洗。清洗出水口和底座外侧，马桶有很多小地方都是比较容易藏污纳垢的，比如马桶的内缘出水口处和底座外侧，在清洗的时候，可以先把马桶圈掀起，并用洁厕剂喷淋内部，等到数分钟后，再用马桶刷彻底刷洗一遍。
盖上马桶盖冲水，在冲水的时候，细菌会跟着冲水的气流向上冲，这样细菌很容易落在卫生间的其他物品上，比如牙刷、毛巾和漱口杯等等，所以在上完厕所冲水的时候，最好养成冲水时盖上马桶盖的习惯。厕所尽量不设废纸篓，大多人都会在厕所放一个纸篓来装用过后的手纸，看似很干净的布置，其实是错误的，因为我们使用过的手纸，上面就有很多细菌，放在厕所里很容易导致细菌大量的滋生，所以如果要在厕所放置纸篓的话，一定要选择有盖子。马桶刷是我们用来保持马桶干净时用到的，每次在刷完污垢的时候，上面都会沾上脏东西，不管是我们看的见还是看不见的，都需要随手再冲一次，冲干后把水沥干，喷洒消毒液，或者定期用消毒液浸泡，并放在合适的地方。马桶的釉面需要定期的清洁，可以用肥皂水或者是中性的清洁剂，清洁后，注意要擦干釉面水迹。严禁用钢刷和强有机溶液清洗以免破坏产品釉面，侵蚀管道。
马桶刷是清洁马桶常用的清洁工具，在清洁完马桶之后，马桶刷一定要清理干净，如果不注意马桶刷的清洁和干燥，它也会成为污染源。每次刷完污垢，刷子上难免会沾上污物，建议先用清水冲洗一遍，待水沥干后，再喷洒消毒液，把马桶刷挂在通透的地方，不要随便放在角落里，也不要放在不透风的容器里。在清洁马桶时，一般人们会把清洁剂浸泡在马桶的时间过于太长，觉得浸泡时间久，很容易就会把污渍清洁干净。
其实有时一些劣质的清洁剂换回伤害到马桶，所以清洁剂的浸泡在马桶内的时间大概是一刻钟。在做清洁的之后，不要清洁剂残留在马桶内，一面导致生锈。在清洁时使用柔性好的布料，不要使用钢丝球，铜丝清洁刷、绿色或白色的百洁布等材质比较粗硬的器具，以防刮损防滑层或表面瓷釉层。
马桶一般的清洁使用洁厕灵，洁厕净即可，一般超市都有卖，这个清洁是每天都要做的，避免在后期出现难以对付的污渍。马桶不能定期做清洁，一般就会出现难以去除的污渍。这个时候，我们可以使用84消毒液。讲原液直接倒入马桶中，等待一刻钟的时间，然后在做常规的清洁。如果污垢在水浸泡不到的高位置，可将用过的面膜贴布浸透84消毒液原液后覆盖在污垢表面达到浸泡的目的。注意：一定不要使用钢丝球来擦洗，以免破坏马桶表面釉质。在使用马桶后要及时冲水，一般人们冲水时，马桶盖都是打开的。这样的方式是错误的。马桶内的瞬间气旋可以将病菌或微生物带到6米高的空中，并悬浮在空气中长达时间很久。因此，应养成冲水时盖上马桶盖的习惯。
