经过一晚上的休息，眼睛的疲劳感虽已不再，但也不能马上让眼睛去近距离地专注一样事物，很容易引起快速疲劳。而晨跑就能很好的改善这一点，因为跑步时眼睛需要直视前方，让眼睛得到再次充分的放松，对预防及改善近视有很好的效果。
长期保持坐姿是目前最为普遍的生活状态，正因为如此绝大多数的人或多或少都会患有类似于脊椎等疾病，而跑步的正确姿势对肩、背都有着严格的要求，能起到改善脊椎疾病的效果。
早晨空气中充足的氧气可以使跑步摄氧量达到最大化，这也大大提高了身体各部位的机能，加快血液循环，长期坚持有强健心肌、预防多种心脏疾病的效果。
晨跑对减脂瘦身很有效果，特别是空腹。因为身体经过一个晚上的消耗，体内的糖原已经不足以再为跑步提供能量，只能直接消耗脂肪来达到供能的目的。
一晚上的消耗很可能导致在心血管中堆积了一些杂质，而晨跑能迅速改变人体的新陈代谢率，加快血流速度，将杂质排除体能，从而降低血脂和胆固醇。
中长跑会加速血液循环，使冠状动脉有足够的血液供给心肌，从而预防各种心脏病。通过下肢的运动，促使静脉血流回心脏，还预防静脉内血栓形成。
