1、对粉碎机机舱的清洗。粉碎机机舱也就是我们所说的“粉碎仓”，物品粉碎都在粉碎仓里来进行，所以是重点清洗的部位。粉碎仓与电机的主要固定部位在机舱内部的“刀头”部位。刀头上面由一个不锈钢螺丝固定，只要用扳手把这里的螺丝松开，把刀片拿下来，就可以把机舱和电机分离，分离的时候注意把链接线拔下来。粉碎仓的清洗工具涉及专用扳手、毛刷等。粉碎机都配有专用扳手，正好方便拆卸刀头时使用。
久品中药粉碎机也配有专用的清洗用毛刷。请大家在中药粉碎机清洗的时候用清水清洗，不要用其它清洗剂，最多可使用洗洁精来进行清洗，洗完后要用干抹布擦干。
2、对研磨清洗的其他部分：主要对与螺旋盖和外部部件进行清洗粉碎机。这些地方都可以用来刷毛刷轻轻刷干净，必要时用水或清洁剂来清洁它。将产品喷水浸湿，然后倒入洗涤液，将洗涤液与水之间搅拌均匀，也就能均匀的布满产品的表面，这样，污垢也就在这个过程中慢慢的没有那么黏住中药粉碎机了。
小型家用粉碎机可以将刷子浸湿，开始刷洗表面以及内部，这样的清洗会使得污垢在瞬间大部分的脱离该产品，无论是表面的还是内部的。这个过程完成之后，就拿清水冲洗粉碎机，避免已经脱落的污垢再次污染该产品，因为造成二度附着的现象是比较糟糕的。
还有一种方法是使用清洗机进行中药粉碎机清洗，将清洗机内注满水和洗涤剂，然后将需要清洁的中药粉碎机放入其中。
之后清洗机就开始运作了，里面的水流会产生强大的流动力，这样使得粉碎机内部的污垢大量的脱落且由于水的快速流动而不易再次附着在上面，效果也是非常的理想。
中药粉碎机之后用清水清理干净，再进行相关的干燥工作，以免水分遗留时间过长造成不必要的损失。
中药粉碎机在制药行业中的意义重大，但是在中药粉碎过程中，还有很多情况值得注意。如绝大多数的中药是天然动植物，组成成分复杂，包含各种小分子化学成分、大分子有机物(蛋白质、核酸、脂类和糖类)、无机物(水、盐、离子)和细胞后含物(代谢中间产物、废物和贮藏物质等)。中药的用药部位复杂，包括花、叶、根、茎、全株等多种部位，各种不同部位间其性质差异很大，从细胞层面，其由外到内的各层，例如木栓层、皮层、韧皮部、形成层、木质部、射线等由不同种类细胞构成，其构成细胞如薄壁细胞、石细胞、导管、木纤维、木栓细胞等破壁性能是不同的。中药粉碎机在现代制药领域中的应用是最为广泛的，中药粉碎机不仅可以用来粉碎中药，还用来粉碎五谷杂粮，如黄豆、玉米、辣椒等，磨成面粉食用，它的操作简易、清洁方便，甚至在普通家庭也得到了广泛运用。中药粉碎机一般都有残留，有些材料有粘性，会黏在仓壁，建议用木有或者塑料勺子铲一下，或者直接将仓拆下来用水洗干净后晾干，装回去！使用时尽量短时多磨，也能够减少粘底情况。
对于中药粉碎机经常使用清理的方法，就是先用毛刷刷尽粉碎通道及相关部件上的药料 ，再用水冲洗。这种常规清洗方法对通道中手触及不到的部位及一些死角无法洗净 ，时间久后 ，这些沾在死角上的粉尘药料就会生霉 ，从而影响药物的卫生学要求。 粉碎完药物后，断掉设备电源，打开粉碎膛门，取下环状筛板，用干毛刷简单将粉碎膛中的钢齿圆盘，粉碎室及出粉道中的药粉掏刷出来 ，再关上并拧紧膛门，出粉通道口下放，接一水桶或大口径水盆，再开大加料斗口，接通电源，启动粉碎机进行空转，从加料斗内加入干净的自来水进行冲洗。此时加入的水流在机内圆盘的高速转动下，借助强烈的气流， 水流快速冲洗粉碎室及通道中的各个部件，最后机内水流经出粉通道口流入接水桶或盆内。中药粉碎机在进行清洗工作的时候，必须的要进行的彻底，如果内壁有附带有粉末，必须的要进行清理工作，才能保证下一次的使用更有保障。
