于曼丽作为一个职业特工和杀手，其实就是被军统捆绑的一具行尸走肉，除了卖命，她不能有自己的理想和追求，同程锦云相比，一个胸怀天下、救国图存，一个只知儿女情长，听命于人，显然与明台的理想和追求格格不入，从这一点上说，明台选择程锦云也是顺理成章，而不是什么导演安排，剧情需要，如果明台从始至终都是一个纨绔子弟、社会混混，你若让他选择程锦云，那才是被需要，才是被安排。
程锦云是大姐介绍给胡歌的，还带着明台去相亲，大家都知道大姐明镜可是个有本事的女人，在家是一家之主，在外是女老板，她看上的人，就不会太差，对于自己的弟弟的婚姻，大姐更定会上心，所以大姐暗中过程锦云，才会介绍给明台，这样知根知底的人在一起大姐会放心，明台也安心。而于曼丽就不太清楚，虽说他们在一起共过事，但只是表面，实际上根本就不知道她的背景有多复杂。
个人觉得有以下几方面原因。趣味相投，志向一样。程锦云她跟明台的志向是一样的，都是想拯救国家拯救人民，想为抗战贡献自己的一份力量，剧中于曼丽多次表白明台，从明台的犹豫就看得出来了，因为明台知道跟于曼丽在一起意味着什么，意味着很可能要抛弃自己的理想，而跟程锦云在一起就不会存在这种问题，所以即使于曼丽没有牺牲，明台还是会选择程锦云。
反正不光是因为爱情！为什么会选择陈锦云？主角光环是其一，为了符合电视剧的背景和主旋律，陈锦云是中国共产党员，那是坚定的信仰！明家三兄弟和大家都是中国共产党党员，所以明台的妻子自然也必须是朝着光明的信仰！最后是陈锦云的人设吧，她的背景肯定比于曼丽好太多！所以，基于家庭背景，主角光环以及信仰问题，明台选择了陈锦云。
明台会选择程锦云，那是必然的。从整体角度看，程锦云适合当妻子，而于曼丽则适合当情人，这一点，想必明台是看的很清楚的。于曼丽性格多变，可以小女人，也可以性感妩媚，天生就带着情人的气质，不适合居家男人。而程锦云端庄，大方，适合居家过日子。明台作为一个情报组长，自然有足够的分析能力去对比这两个人，谁更合适自己。
志同道合，信仰相接，在剧中明台和于曼丽也有感情瓜葛，可以说是除了于曼丽是国民党，其于都比较完美，当然于曼丽作为一个过去有过一段灰暗的经历，这点对于一个男人来说比较难以接受，而程锦云就不一样了，她是一个地下党，这点和胡歌明台有着共同的信仰，在一起就比较方便，相互配合。
