乙肝疫苗是预防乙肝的根本途径。目前使用HBsAg基因工程疫苗。经上亿人次接种，证明该疫苗安全有效。凡HBV标记物阴性者均应接种。免疫途径有肌肉，皮下和皮内注射多种。但不主张臀部注射。使用重组乙肝疫苗的免疫效果可达95%以上、围产期母婴阻断效果可达90%。注射了乙肝疫苗全程免疫后，乙肝病毒的感染率极低。目前国内已把乙肝疫苗列入计划免疫。对乙肝疫苗无应答者或低应答者的处理，并不是一件简单的事情。处理前，需排除是否存在低水平的乙肝病毒HBV感染。现已发现，部分无应答者经聚合酶链反应(PCR)技术证明体内存在HBV-DNA。下列措施对提高无应答或低应答者的抗-HBsAg水平有一定帮助。乙肝疫苗目前国内剂量最大的是深圳康泰的60ug乙肝，一般接种后半个月开始有抗体产生，具体每个人不一样，快的可能还要早。疫苗在一定范围内具有量效关系，也就是增加剂量会使效果增加，60ug一针法对一部份三针法仍然阴性的人，可以起到转阳也就是起效的作用，同时一次注射产生抗体滴度相对较高，但持续时间目前认为还是3针法更长一些，接种1针后建议一个月后复测抗体，如果阳转，以后复种时接种1针即可。乙肝疫苗接种后反应，这是乙肝疫苗本身的特殊所致的反应，其表现的强度随疫苗而不一样。乙肝疫苗的反应分为局部反应和全身反应两种情况：乙肝疫苗接种后反应一，全身反应。少数人接种某种疫苗后会出现发热、头痛、头晕、乏力、嗜睡和周身不适等全身反应。极个别人还可以发生恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。这种全身乙肝疫苗反应，通常也是短暂的，大多在24小时内消失。
根据有关研究资料证实，对成年人注射乙肝疫苗以后产生表面抗体者，五年后复查尚有60%的人血清中表面抗体仍然阳性。对母亲为乙肝病毒携带者所生的婴儿，用乙肝高效价免疫球蛋白与乙肝疫苗联合注射阻断母婴传播，产生表面抗体的婴儿，随防观察两年，其血液中乙肝表面抗体仍全部阳性。关于接种疫苗后产生的免疫力到底能维持多久，一般认为接种疫苗产生的抗体，免疫力能维持3-5年，以后应加强注射一次，但最好是在接种后每年检测一次血清表面抗体，如表面抗体转阴或水平下降，则应进行一次加强注射，剂量是成年人20-30微克，儿童10-20微克。
