一是合同的有效性问题，在我接触的建筑工程诉讼中，工程款的取得首先要解决合同的有效性问题，由于目前建筑市场中普遍存在挂靠、借用资质的现象，因此这些都会导致施工合同的无效，贵公司作为施工单位，还有就是是否存在转包、违法分包的情况，这些都会导致合同本身的无效，但是即使存在合同无效，如果建设单位没有提出合同无效的抗辩或者工程质量合格，你还是可以参照施工合同取得工程价款。
二是合同的相对行问题，由于目前挂靠、借用资质以及转包情况较多，如果你们要提出工程款请求，必须和业主存在直接的合同关系或者有有效的授权委托，否则业主有权拒绝付款。
三是工程结算方式及数额的问题，工程款结算是施工企业工程款清欠的核心环节，也是发承包双方的争议焦点。施工合同价款确定有三种方式，即固定价格合同、可调价格合同和成本加酬金合同。不知道你们的合同属于何种情况，根据我的经验，目前较多使用的是采用可调价格合同。如果是这类合同，就存在工程结算数额特别是工程洽商变更确定的问题，如果双方对于工程结算已经有文件则按照该文件执行，如果存在争议则可申请司法鉴定，按照鉴定结果给付款项。
四是开发商业主违约导致的违约责任问题，如果双方合同对此没有特别规定，那么对于拖欠的工程款可以按照同期同类贷款利率计息。工程款拖欠利息从应付工程款之日开始计算，当事人对付款时间没有约定或者约定不明的，下列时间视为应付款时间：(一)建设工程已实际交付的，为交付之日;(二)建设工程没有交付的，为提交竣工结算文件之日;(三)建设工程未交付，工程价款也未结算的，为当事人起诉之日。
五是诉讼时效问题，工程款超过诉讼时效，施工企业将丧失胜诉权，对方可以此为由拒付工程款。工程款追索的诉讼时效一般为2年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。如果主张预付款或进度款，则从合同约定的应付款之日起算;如果主张结算款，则从结算完成后的约定付款之日起算。工程款追索的诉讼时效为2年，这是一般原则，特殊情况下诉讼时效可以延长。
六是对于施工单位的特殊保护问题，由于目前建筑市场竞争非常激烈，施工单位在工程欠款诉讼中往往处于低人一等的地位，权利维护难度很大，根据我办理建筑案件的经验，我认为一方面要及时起诉，对于久拖不决的欠款，要及时行使诉权，在诉讼中可以采取保全房屋财产账户的方式促使其及时付款，另一方面要注重采用我国俄合同法对于建筑企业的一项特殊保护权利，即建设工程价款优先权，工程款优先于银行的抵押权，发包方不能按合同支付工程款，经催告，施工企业可以申请人民法院拍卖在建工程或已完工工程，拍卖所得优先支付给施工企业。但建设工程价款优受偿权从竣工之日(已完工工程)或约定竣工之日(在建工程烂尾)起必须在6个月内行使，且不得对抗已付清大部分房款的消费者。因此，当发包方出现财务危机，诉讼难以避免时，施工企业应当在竣工后6个月内及早向发包方催促工程款，否则过了6个月以后，工程款优先于银行抵押权的权利就不复存在，施工企业很有可能打赢了官司拿不到钱。
总之，工程欠款诉讼难度较大，一方面要照顾取得工程时的合作关系防止对今后承揽工程不利，另一方面也要积极维护自己的合法权益，该争就争，通过律师函、诉讼向对方施加压力，加大问题解决力度，防止出现久拖不决的不利局面。
一是交涉、要回要及时。交涉、要回的方法很多， 口头的、书面的都可以，尤其是在通信、交通日益发达的今天，及时交涉、要回，就有机会早日解决问题，就能减少施工企业可能遭受的损失，而且还有利于继续履 行合同;二是收集证据要及时。
及时收集证据有三方面的意义：
首先是能够保全证据，有些证据如施工中隐蔽工程验收中的用材、质量问题等，错过了机会就有可能难以获得该方面的证据。
其次是便于分析案情和作出判断，律师分析判断案情是否准确，与手中掌握的证据材料是密不可分的，因而越早掌握证据就越具主动性;最后是有利于及时采取何种 对策或者措施，解决拖欠工程款纠纷的过程漫长而复杂，及时采取对策或措施就能赢得战机，而要及时措施必须以及时取得证据为前提。
三是申请支付令或者提出起诉(包括申请仲裁，下同)要及时，在吃透案情、掌握证据，但又无法协商解决的情况下，律师就要果断地代 理施工企业及时申请支付令或者提出起诉，否则就是贻误战机，尤其是对那些资信情况不良的建设单位而言。
