酒精与碘酒都是外用消毒剂，但它们也有一定区别。酒精的消毒杀菌原理是由于酒精能使菌体蛋白质脱水、凝固、变性，进而杀死细菌，并能抑制细菌芽孢发芽，但不能杀灭芽孢。乙醇属于中效消毒剂，其杀菌作用较快，消毒效果可靠，对人刺激性小，无毒，对物品无损害，多用于皮肤消毒以及临床医疗器械的消毒。主要区别就是碘酒要脱碘，并且有可能有人过敏。碘酒是绝对外用的，酒精用途相对广泛。但是只有碘酒消毒是确切的，换而言之碘酒消毒能力大于酒精。故外科皮肤消毒还有沿用老的碘酒消毒法至今未变，有看上面说现在外科不用了的，有关这个首先我所在医院没有只使用酒精，一般用碘伏多，其次第八版外科书里还是选用碘酒消毒。所以碘酒还是有它存在理由的。
碘酒是含碘、碘化钾及乙醇。外用用于皮肤消毒，但应该使用75%酒精进行脱碘，要不然会烧伤皮肤。药用酒精(乙醇)是医疗单位和家庭药箱的必备药品，值得注意的是，不同的用途要求不同的浓度。碘酒是碘和碘化钾的酒精溶液，碘酒中的碘元素可直接卤化菌体蛋白质，使蛋白质变性沉淀，并使酶蛋白氧化而失活，进而杀灭细菌。其杀菌作用强而快，2％碘酒互分钟可杀灭各种细菌、霉菌和细菌芽胞，所以碘酒的消毒效果好于酒精。但碘酒对皮肤和粘膜的刺激性较大，可损伤皮肤和粘膜，所以用后要马上用酒精脱碘，防止碘刺激皮肤引起发泡及脱皮，甚至引起皮炎，对碘过敏者可引起全身的皮疹反应。
