既然这个问题是问“有什么不同”，我想就从纪录片表现手段的技术层面做一个回答。纪录片的记事手法在精度、节奏、视角上都有区别，这里我先谈一下精度。纪录片有太多的门道，自然类、文献专题类、历史文化类、社会生活类、人类学记录类、风光记录类等等……南加州大学的麦克雷诺在90年代初也提出自己的分类方式。当然影响力最大的是尼科尔斯的类型学理论。然而洞中方数日，世上已千年。与时俱进的尼科尔斯也落后了，想知道纪录片的定义和分类的朋友，去看看《纪录片研究》，一部关于纪录片的百科全书！从大的形式属性上划分，这两类纪录片应该是属于同一范畴的，都是一现实主义为创作基础的记录。换句话说，《本草中国》是以药材为主记录药性、药材等，注重教育性；而《秘境神草》则更加贴近人们的生活，从老百姓生活的秘境中到发掘本草，是以普通人的视角，更加注重文化的传承。两档节目所呈现的不同方向，就是纪录片的精度。对于《本草中国》和《秘境神草》节奏的掌控方面，来源于三个方面：表现的平台、观演关系，以及所追求的艺术效果。首先二者都借助了电视这个表现平台，那么二者的分别就是摄像机和摄影机的镜头，镜头又分为不同的景别。全景，人物可以像话剧等大场景的表现尺寸，进行肢体和语言的适度放大；中景，人物回归生活化的表演尺寸；近景和特写则需要人物在生活化的基础上进行一些适当的情绪放大。在这一点上，二者无差。
首先，题材选择不尽相同。《秘境神草》以“一户普通人家、一味野生本草、一段人生故事”为线条，主要反映人与自然、人与本草的中国故事。它有很大的两方面优势便是：秘境和野生本草，纪录片里每一个呈现出来的地方都是极其特殊的地貌。而《本草中国》将以"中国非物质遗产中药炮制技术及中药传统制剂方法传承人"为灵魂展开，引导观众走进神秘神奇的中药世界。在探寻道地药材、还原炮制技艺、点拨医药原理的过程中，完成对中医药文化的启蒙和普及。它多数为种植题材，相比之下，没有地貌的独特性看点，但老百姓的故事还是很值得一看。这一点《秘境神草》的总导演也在采访中明确说过。
医者仁心，《秘境神草》和《本草中国》两部纪录片都给人带来了非常大的感动，并且给了国民信心，一种对于中医复兴的信心。这一点从《秘境》中显得尤为突出，整部片表达的就是一种传承的精神，从这部片子的制作手法中能够看出导演的诚心！在两部纪录片的观影体验上我更喜欢有着深远内涵的《秘境神草》。但为什么说《本草中国》更感人呢？因为它更注重人情，拍摄一些比较接近观众生活的故事。比如，一个制药人穿着斗篷在庭院里蹲着看雨，它会去用镜头表现一个人的情感，让观众融入情感中，并被感动。 《秘境神草》楼上也有人说过，它注重秘境，注重大自然，注重原生态，因此描写感情时并没有那么细致。
