在《倚天屠龙记》中明教一直被正派人士视作邪魔外教，而且一直被中原武林人士敌对；当然了其中对于明教仇恨最深的是灭绝师太，她直到死也不和明教和解。灭绝之所以对明教会有这么深的仇恨，都来源于明教对于峨眉派的仇恨；与灭绝师太关系十分要好的大师姐，便死在了明教的手中；加上自己的爱徒纪晓芙又被明教光明左使杨逍勾引，从而背叛师门堕入魔道。这种种原因加起来，使得灭绝对于明教极度仇视，最终宁愿死也不愿意与他们和解。
和少林齐名的六大门派之一峨眉派，也是《倚天屠龙记》中唯一一个和明教势如水火的帮派。可能其他的门派仇视明教，有着各自的小算盘；也许是为了响应其他武林正道的号召，还有可能是为了从中扩大自己门派的影响力，以及从剿灭明教的过程中，获得渔翁之利。但只有峨眉派是真心的想要消灭明教，因为峨眉派掌门人灭绝对明教有着深仇大恨；之所以会出现这样的情况，都是因为下面这两个人。
第一个人：灭绝师太大师姐孤鸿子，作为灭绝最为亲近的大师姐，因为和杨逍比武，被活活气死。这使得灭绝和杨逍结下了不解的仇恨，而各自所属的阵营又是峨眉派和明教，所以便上升到了门派间的矛盾。
第二个人：灭绝师太的爱徒纪晓芙，前有孤鸿子，后有纪晓芙；可以说纪晓芙的背叛师门，让灭绝彻底的痛恨上了明教。原本乖巧听话的徒弟，在接触杨逍以后，便爱上了杨逍，并且背叛了师门，与杨逍生下了女儿。
在新仇旧恨加在一块的情况下，灭绝怎么可能不痛恨明教；所以在最后被困万安寺时候，能够有被救的机会，也不想欠明教这个人情，而最终选择了孤身赴死。
灭绝师太对于明教恨之入骨，这是因为灭绝师太的师门里的一些长辈，和自己的亲人都是和明教争斗当中被明教所杀，所以她就一直深深的恨着明教。
因为灭绝师太的师父孤鸿子是被杨逍害死的，她最喜爱的徒弟纪晓芙也是因杨逍而死。
灭绝和孤鸿子之间，有着特殊的感情，所以，灭绝才会如此痛恨明教。
哥哥和爱人都因明教而死
