人的口腔内，菌群种类繁多，包括真菌、古菌、支原体，偶尔还有病毒栖居或路过，它们分布在牙齿、龈沟、舌、颊粘膜、硬腭、软腭、扁桃体这些部位，形成口腔微生物群/组，细菌占其中的优势地位，在已知的六七百种常见细菌中，约一半多的种类可以被培养，其余的需要通过分子技术进行检测。这些定植于口腔的菌群，群组之间共生、拮抗、互生、竞争，与口腔组织器官，形成一个动态的微观生态区，平衡时口腔为正常健康，失调则口腔患病。
.口腔在唾液的不断沐浴中，唾液是一种特殊的分泌物，含有大量抗菌的活性成分，对于保持口腔的健康起着极其重要的作用(1)。这些唾液来源的物质，通常为蛋白质，主要在大小唾液腺中合成(2)，但也有相当部分通过龈沟液来源于血液或直接来源于口腔的多形核细胞(PMN)(3)，通常，唾液中的抗菌物质分为非免疫球蛋白-内生因子、免疫球蛋白-获得性因子。
链球菌属(Streptococcus Mitis) ——部分具有溶血致病性，与猩红热(Scarlet Fever)等传染病有关，能产生多种毒素，引起细菌性心内膜炎、肺炎、喉咙发炎等。 而一般口腔内常存者为腐物寄生菌，会趁口腔有伤口或烂牙而寄生其中。
一个人的口腔中有多少细菌?据专家研究，一个清洁的口腔，每颗牙齿表面有1000—100000个细菌；而一个不甚清洁的口腔，每颗牙齿表面可有l亿一10亿个细菌。一个人有32颗牙齿，可见口腔细菌数之多。
脑血管疾病和牙周炎诱发心肌梗塞和冠心病一样，牙周炎也可诱发缺血性脑中风。牙周炎成为脑中风、冠心病和心肌梗塞的危险因素。研究证明牙周炎作为脑卒中的危险因子大于吸烟，而且独立于其他已知的危险因子。
在一项研究中，研究人员发现在发生脑内出血的病人中，有26％的病人唾液中存在一种特定类型的细菌——CNM阳性变形链球菌。在其他类型的中风病人中，只有6%的病人能够检测到该细菌的存在。
