一、体育锻炼着重调身，即形体的锻炼，其调息的目的是为了在激烈的体育锻炼过程中得到充足的氧气供应，并不断地从体内排除二氧化碳，以保证大脑、肌肉所消耗的能量得以及时的补充，从而保证体育竞技顺利进行。也就是说其目的在于使形体的锻炼得到充分的发挥。而调心也同样是为了保证形体的完美发挥。气功与此不同，气功的三要素中，调心起着决定性的主导作用，调身只是顺利进行调心、调息的重要条件，调息则有助于体势的放松和精神的宁静。三者有机地结合起来，逐步达到气功入静状态，并在意识的主导下进行机体内部功能的自我调整和锻炼，通过特殊的心理过程来改变自身的生理状态，达到治病强身的目的。
二、与体育锻炼相比，气功更强调人的心理状态对人体健康的影响，强调通过主动的自我精神活动来调整自身的生理活动。在气功入静状态下调动和培育人体的生理潜力，起到强身治病的作用。
三、气功锻炼是在气功入静状态下进行的有呼吸要求的运动，它要求在保持松静自然的基础
上，全身协调运动，呼吸柔和细缓，使耗氧量降低，心率减缓，血压降低，在整体上提高身体素质;这与一般的体育锻炼使呼吸加快，耗氧量增多，心率加快，血压升高，从而加快身体某些部分的新陈代谢，使形体按特定的要求完美发展等，有着很大区别。
两者的区别，根本仍在于是否内向性运用意识。体育运动除健美锻炼外，任何项目无一不是外向性运用意识，即精神不是专注于自己的身心活动上，而是注意在运动项目的对象上。
由于精神没和自身生命活动紧密结合，就不能发挥意识强化生命力的特殊作用。因此使气功与体育锻炼结果呈现出明显的差别。可从几个方面分述之：
一、就锻炼内容言：气功包括涵养道德、运用意识、调整呼吸、运动形体。而体育运动主要是运动形体。
二、就运动形体言：气功着眼于神、意、气的锻炼，强调以意引气，以气引形，形体的运动为神、意、气“服务”，要在“松静”中体会奥妙。
体育运动着眼于各种动作的锻炼，精神不是集中在体内，而是集中于形体的动势或器械上，“神”的作用在于集中精力、协调全身以完成一系列动作，精神为形体运动“服务”，各个动作需通过肌肉、肌腱……的紧张(张缩)来体现技巧。
三、就精神驾驭形体的形成过程言：气功是通过内向性运用意识主动发放意识指令直接统帅形体。体育运动是通过形体运动反射性地引起精神驾驭形体。
四、就人体的新陈代谢变化言：体育锻炼要消耗大量的能量，增加体内的新陈代谢，使体内耗氧量剧增。由于体育运动主要是肌肉运动，将体内的化学能转变为机械能(还有一部分变为热能而耗散)，这就需要相应地补充营养，保证休息，以恢复体力。
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