1、在林奈（1735)建立的两界分类系统（动物界和植物界）中，真菌属于植物界。
2、在Hogg(1860）和Haeckel(1866）先后建立的三界分类系统（原生生物界、动物界和植物界）中，真菌属于原生生物界。
3、在Copeland(1938）建立的四界分类系统（菌界、原生生物界、动物界和植物界）中，真菌属于原生生物界。
4、在Wittaker(1968）建立的五界分类系统（原核生物界、原生生物界、植物界、真菌界和动物界）中，把真菌单独作为一界处理。这是一个比较完整的纵横统一的系统，在纵的方面显示了生物进化的三大阶段，即无细胞生物→原核单胞生物→真核（单胞→多胞）生物。在横的方面显示了生物演化的三大方向，即光合作用的植物，吸收营养的真菌和摄食的动物。
真菌是一类微生物，其中部分可以导致疾病。有真菌感染引起的疾病被称之为真菌病。真菌无处不在，每人每天都在频繁地与真菌接触，但不是人人都有患有真菌感染。因为真菌生存需在适当的温度、湿度，加之人体有一定防御功能，所以并非接触就发病，身体抵抗力低，过度肥胖，易出汗者特殊职业：驾驶员、矿工、战士、运动员；以及应用激素及免疫抑制剂治疗者，过团体生活或常常有机会接触真菌的人较易感染。 由真菌感染引起的皮肤病较多，临床常见的有：头癣、手癣（鹅掌风）、足癣（脚气）、体、股癣等多种癣病。
（fungus；eumycetes）是具有细胞核和细胞壁的异养生物。种属很多，已报道的属达1万以上，种超过10万个。其营养体除少数低等类型为单细胞外，大多是由纤细管状菌丝构成的菌丝体。低等真菌的菌丝无隔膜，高等真菌的菌丝都有隔膜，前者称为无隔菌丝（coenocytichypha），后者称有隔菌丝（septatehypha）。在多数真菌的细胞壁中最具特征性的是含有甲壳质(chitin），其次是纤维素。常见的真菌细胞器有：线粒体，微体，核糖体，液泡，溶酶体，泡囊，内质网，微管，鞭毛等；常见的内含物有肝糖，晶体，脂体等。
真菌（Fungus）一词的“拉丁文”Fungus原意是蘑菇。真菌是生物界中很大的一个类群，世界上已被描述的真菌约有1万属12万余种（属与种都是单位，且属大于种），真菌学家戴芳澜教授估计中国大约有4万种（种为单位）。按照林奈（Linneaus）的两界123分类系统，人们通常将真菌门，分为鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门。其中，担子菌亚门是一群多种多样的高等真菌，多数种具有食用和药用价值，如银耳、金针菇、竹荪、牛肝菌、灵芝等，但也有豹斑毒伞、马鞍、鬼笔蕈等有毒种。另外，半知菌亚门中约有300属是农作物和森林病害的病原菌，还有些属是能引起人类和一些动物皮肤病的病原菌，如稻瘟病菌，可以引起苗瘟、节瘟和谷里瘟等。
