我觉得《工作细胞》一直都是以科普为目的而将故事内容一点点进行刻画的，它主要是靠将身体里的细胞进行拟人化，已经将外界细菌病毒等等拟人化，把他们在以身体为战场，身体细胞们守护着身体的安全为主线展开的。
实际上在《工作细胞》这部动漫里，出现的所有反派病毒们都在我们的日常生活中有迹可循。基于这些故事都是想要起到科普的作用，自然不会挑选太过冷门的病毒病菌，或者不常见的病来作为案例展现给我们看。那么我觉得《工作细胞》的最终boss身份也不会脱离我们的生活。我认为最终boss就是一直在我们身体里面的癌细胞。现在的癌症已经是一种非常的普遍的病了，这可能和癌症的种类非常多有关。
实际上癌细胞也是一个看起来比较无辜的细胞，毕竟他们只是想要繁衍扩张，最初的癌细胞还不具有危害性，他们叫“当麻细胞”。而当这些细胞转变为癌细胞以后，就有了无比可怕的战斗力，要知道nk细胞都没办法打过癌细胞呢。癌细胞很难靠自身的免疫系统消灭，自然也就在身体里有着非比寻常的可怕威力，他们赶不走，几乎消灭不完，被称之为最终boss再合适不过。而癌细胞从诞生开始就会被身体里的其他细胞排斥，他们追杀癌细胞，让癌细胞自己也觉得很委屈，他只是想要在身体里生存下去罢了，为什么大家都想着杀害他。
单看这里，不联想到现实，大家甚至觉得癌细胞真心有些可怜。但是单看癌细胞无限扩张和在身体里转移的能力。一旦身体里的细胞们放过癌细胞，就只能让癌细胞疯狂扩增到全身，占据人的身体，最后和所有细胞们一起走向灭亡。所以有些细胞天生就是反派，这也许也是一种悲哀吧，没有人天生想当癌细胞这样的存在，因为他们的生命就是源自于无限扩增，他们的本性决定了他们无法和其他细胞共存。所以即使癌细胞有再多的苦衷，看起来再无辜，甚至在最开始并没有做坏事，我们也只能看着身体的其他细胞和他们走上你死我活的道路了。
以上纯属个人观点哦。
应该是细胞的衰老，总有一天，身体里绝大多数细胞，包括免疫细胞，都已失去机能，成为免疫细胞的敌人。
我觉得是艾滋病毒吧！艾滋病是将体内的免疫细胞杀死，然后随便一个感冒都可以杀死你！
带有天然免疫抑制功能并且会导致细胞炎症风暴的病原体
最终的boss人物应该是里边的红细胞
我认为是艾滋病毒，直接攻击免疫系统
