理论上，转基因食物的基因是无法在人体内表达的。首先解释下转基因食物，所谓转基因食品，就是将外源基因（比如不同物种的）导入受体物种中，并整合入受体物种的基因中，以期表达需要的蛋白，达到抗病性、耐药性或者高产等需要的特性。楼主所提到的有毒蛋白，就是作物表达抗药性的一种蛋白，比如，你给水稻导入了抗棉虫的基因，水稻就会表达该蛋白，达到抗棉虫的效果，而这种抗虫蛋白并不会对人体有危害。再来说下楼主关心的问题“转基因食物的基因能否在人体表达”。其实所有的食物在体内摄入都是以蛋白，脂肪的形式被消化和吸收的，所谓基因，也不过是核糖核酸，在摄入人体之后，会被分解吸收，并不会以基因的形式表达，就比如你吃生的三文鱼的时候，三文鱼的基因也不会在你体内表达。目前，关于转基因食物其实并没有确凿的证据显示其对人体有危害，也没有任何证据显示转基因食物的基因会整合到人体内表达，争议的焦点是，没有证据显示转基因食物到底有没有危害？所以还需后续的实验来证实这一难题从目前人类掌握的理论上来说，外源基因会被消化道分解后才能摄入，而且在人体内没有相应的基因表达环境，所以不可能表达蛋白。但这些永远不能绝对说，科学技术永远在进步，比如：人类现在已经发现有些植物的RNA能躲过消化系统直接进入血液，那么DNA直接进入血液就有可能，也许这些基因都会影响人类，只是现在人类还没发现罢了。不过，就目前来看，全球食物短缺，非转基因食物根本供应不上人类的需求，转基因食物是必然之势，所以安心吃吧····。
摄入的外源基因是不会在人体中表达的。只会作为核苷酸代谢掉，还没啥营养。关于说的Bt蛋白对人体是否有健康影响。肯定是没有的，因为Bt蛋白作用于昆虫肠道上皮细胞上引起细胞膜穿孔，靶标专一性很强，人体没有这个受体。关于这个的主要担心在于是否会在选择压力下出现抗性很强的超级害虫。所以题主的问题应该从 “转基因食物是否有毒蛋白影响人体健康”角度分析：首先，会不会产生有毒蛋白没有证据证实，当然也很难证伪，细胞调控非常复杂也许构建的重组细胞产生了新的有毒的融合蛋白这也有可能。但如果已经推广，那么要相信研究人员肯定是做了大量的工作证明是无害的。其次，现在已经开始做差异性表达的研究工作。在未来，即使是转基因食品，以水稻为例—— 转入的一些抗性性状，高产性状，抗倒伏性状，只在非产品器官中表达。而我们食用的部位—籽粒不含转基因。 这也是不久的将来说服反转基因人士的方向吧。
转基因外转蛋白本身对人体无害，况且蛋白消化都得分解为氨基酸，但关键是国人看这个问题太狭隘了，1，只关注转基因蛋白本身。转基因蛋白的表达及其性状的体现有可能影响植物信号通路，说白了就是影响其他植物内源蛋白的表达和功能，导致植物产生其他潜在的不利于人体的性状并非不可能，比如募集重金属，产生还未鉴定的有害化合物(对人)。2，其实上面这点不是关键也不太可能出大问题，关键是这种跨物种的基因转移要从生态角度去看，而不是单单看对人有无害处，大自然通过几十亿年的选择才决定了现在各物种的基因组，今天人类仅仅为了养活更多的自己而擅改另外一物种的基因组，这种技术一旦泛用后果不堪设想，我知道转基因水稻是不育的，但潜在的生态危害还是相当的。转基因可能是未来一门热门技术，造福人类。
有些人不知道转基因到底是什么，通俗的讲呢就是：比如有一马，一驴，一猪，那么传统育种呢就是马马配，驴驴配，猪猪配。杂交呢就是驴马配，猪马配，当然了，符合自然规律的就配出来了，比如骡子，不符合的就什么都出不来。转基因呢就是，猪和马不是配不出来吗，人工把猪的基因转到马的基因里，如果需要还可以把蟑螂的转进去，或茄子的转进去，然后会出现一个新物种，这个物种是敌是友鬼才知道。所以你是不是博士不重要，重要的是你有没有脑子！这也正是为什么在科学比较普及，人民素质比较高的欧洲，人们称转基因食品为“弗兰肯斯坦食品”的原因，人类创造的科学怪物终将会毁了人类自己！
敬告那些糊涂的中国人:千万不要把利用大分子（原子）化学药品浸泡获得的【核诱变】种子、与人工摘出无用基因片断植入有用基因片断的“转基因技术”混为一潭！！！
被转基因科学家编造而神话的所谓农杆菌，它们永远代替不了智慧的人类有选择性地去摘除无用基因片断并植入优良基因片断。
只要稍微动动脑筋就能想到:与鼠牛羊等动物相比，亿万粒微小的转基因种子，它们只能利用大分子类化学药品以【核诱变】的方式浸泡获得。所以，我们普通民众长期食用当前科学认识匮乏的转基因食品，无疑会导致人体正常细胞逐渐异变而致癌！这仿佛已成为了难以避免的悲哀之事～
其一，人体具有极其聪明的功能，对于进入体内的异常成分自动识别。其二，转基因成分存在于体内等于埋伏生物炸弹，一旦被引爆导致亡国灭种，是终极威慑武器。
