容易长胖，碳酸饮料含糖量普遍在10%以上，一瓶500毫升的碳酸饮料就含有约50克的糖，大约200千卡的热量，需要跑步半小时才能消耗完。世界卫生组织建议，成人和儿童应该将每天游离糖（包括碳酸饮料中的糖）摄入降低到总能量摄入的10%（约50克）以下，进一步降低到5%以下会有更多的健康益处。每天喝一瓶可乐的话糖的摄入总量就超标了。而且碳酸饮料本身属于空热量食物，除了提供热量以外，没有任何营养价值。
碳酸饮料中含量不高的糖分以单糖为主，单糖在进入人体后很快被吸收，升血糖作用明显，长期大量饮用碳酸饮料会使血糖处于一个高水平，一旦减少摄入量会导致血糖不耐受引起不适感。这种不适感就驱使人们继续饮用碳酸饮料来保持这种舒爽的感觉，久而久之，就会导致糖尿病。此外，血糖长期处于一个高水平对肾脏伤害也很大。
碳酸饮料主要是含气体的水，饮后有清凉感，炎热天气，饮上一杯，还是非常舒服爽口的，从而备受孩子和年轻人的追捧。碳酸饮料含有气体，喝入后的第一感觉是肚胀，进而影响食欲，特别是大汗淋漓后饮用冰镇饮料，会使扩张的毛细血管迅速关闭，刺激胃黏膜，造成胃肠功能紊乱，出现恶心、腹泻等胃肠疾病。
过量饮用碳酸饮料有可能会使人体内的钙、磷含量失衡，并且据相关研究显示过量饮用碳酸饮料的人骨折的风险是常人的3倍。此外，青少年儿童处于长身体的阶段，如果过量饮用碳酸饮料，并且摄入的钙磷较少，则有可能影响骨峰量和钙质在骨质内的沉积，为骨质疏松的发生埋下祸根。
大量饮用碳酸饮料会使牙齿受到腐蚀，这是因为饮料中的碳酸和磷酸可以和牙釉质产生化学反应，使牙釉质脱钙，溶解其内矿物质，从而使牙齿变薄、变脆、易碎裂。牙齿产生碎裂后导致牙龈暴露于外，其与冷、热、酸等食物相遇会产生疼痛感。
碳酸饮料中的二氧化碳会抑制胃肠道内的益生菌，进而影响消化功能。此外，碳酸饮料中的碳酸还会刺激胃酸分泌增加，导致有胃溃疡的患者轻则出现反酸烧心等不适症状，重者会出现胃穿孔的危险。
