自从王重阳破解了欧阳锋的蛤蟆功以后，就将九阴真经交给了自己的师弟周伯通，让他找个隐蔽的地方将九阴真经藏匿起来，并叮嘱他不许修炼九阴真经上面的武功。当然周伯通也是谨遵师兄遗命，不敢偷学。后来因为被黄药师夫妇算计，结果导致九阴真经外泄。周伯通为了要回九阴真经副本，去找黄药师理论，结果由于武功不及，被困桃花岛十五年。之后在桃花岛偶遇郭靖，便将九阴真经口诀教给了郭靖，致使自己无意间也练成了九阴真经。
王重阳没有把《九阴真经》给毁了，一方面是前辈毕生心血，另一方面是想让《九阴真经》发挥积极作用，为社会做贡献。
王重阳战胜东邪西毒南帝北丐的目的是拥有《九阴真经》，因为《九阴真经》的存在，江湖上掀起了血雨腥风，王重阳为江湖的平静，为了不再有更多的人因《九阴真经》而丧命，所以王重阳曾经想把《九阴真经》给烧了，这也反应了王重阳的救世济民之心。
在射雕原文中，有这么一段记载：“前辈毕生心血，岂能毁于我手？水能载舟，亦能覆舟，要看后人如何善用此经了”—《射雕英雄传》。
可是王重阳不让周伯通学习九阴真经，很大的原因就是因为周伯通的性格和心怀，达不到能够控制九阴真经的地步。当时王重阳作为天下第一，他心中除了对于江湖武功追求的情怀，心中更是装满了整个大宋。王重阳的心愿就是保家卫国，保卫大宋。可是江湖上无人能够有这样的境界，王重阳让周伯通保管九阴真经，就是希望有这么一个人，可以保家卫国，心怀天下，那时候就是九阴真经出世的时候了。事实证明，郭靖就是这样的人，所以周伯通吧九阴真经给了郭靖。
